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卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò):可預(yù)測混合用藥產(chǎn)生的副作用

EdXK_AI_News ? 來源:未知 ? 作者:工程師郭婷 ? 2018-08-07 10:40 ? 次閱讀
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美國斯坦福大學(xué)(Stanford University)的計算機科學(xué)家設(shè)計出一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),能夠預(yù)測混合用藥可能產(chǎn)生的副作用。

這項研究工作對患者具有重大的現(xiàn)實意義。通常,患者為治療一種疾病或者減輕多種病情而服用的藥物越來越多。但問題在于,我們對藥物之間的相互作用知之甚少,由此帶來了巨大風(fēng)險。據(jù)研究人員介紹,醫(yī)生可選擇的藥物種類繁多,加重了這一問題。她指出,“將一種新藥與其他所有藥物一起測試,這在現(xiàn)實中不可能實現(xiàn),因為針對一種藥物就要進行五千個新實驗?!?/p>

這個問題促使研究人員設(shè)計了“十邊形”(Decagon)系統(tǒng),它是一種預(yù)測不同混合用藥潛在副作用的人工智能應(yīng)用。他們構(gòu)建了一個大型卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),模擬人體內(nèi)超過19000種蛋白質(zhì)的相互作用及不同藥物與這些蛋白質(zhì)的相互作用。研究人員利用記錄了蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)及藥物-蛋白質(zhì)相互作用的數(shù)據(jù)庫來驅(qū)動該模型。他們還加入了詳細描述某些藥物及混合用藥相關(guān)副作用的數(shù)據(jù)庫。

為實現(xiàn)預(yù)測功能,他們選擇使用圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。這種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)常用于社交網(wǎng)絡(luò)和知識圖譜,但還需要對其進行調(diào)整才能用于計算生物學(xué)?!笆呅巍毕到y(tǒng)所用模型納入了對多個邊緣類型的支持,每種類型代表著一種副作用,并采用獨特的權(quán)值分配形式,對圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行了延伸。

該系統(tǒng)的預(yù)測功能還不完美,但在很多例子中都表現(xiàn)了出人意料的準(zhǔn)確性。例如,該系統(tǒng)指出混合使用膽固醇藥物阿托伐他汀和降壓藥氨氯匹定可能導(dǎo)致肌肉炎癥。雖然用于開發(fā)這個模型的原始數(shù)據(jù)都沒有表明存在這種副作用,但根據(jù)一篇已發(fā)表的案例研究,這種混合用藥確實會引起肌肉炎癥,導(dǎo)致患者要在加護病房治療69天。

研究人員檢索相似病例的醫(yī)學(xué)文獻,發(fā)現(xiàn)了“十邊形”系統(tǒng)預(yù)測的前十種副作用中,已經(jīng)有五種得到了證實。但這不表示其他五種預(yù)測是錯的,只是還沒有出現(xiàn)記錄的例子。該系統(tǒng)尤為擅長根據(jù)分子相互作用來預(yù)測副作用,但如果副作用是基于患者的環(huán)境或者行為,那它的準(zhǔn)確性就差一些??偠灾?,研究人員發(fā)現(xiàn)“十邊形”系統(tǒng)遠遠優(yōu)于以往基于計算的預(yù)測,指出“在964種副作用類型中,我們的系統(tǒng)所做預(yù)測分別比其他方法高出了19.7% (AUROC)、22.0% (AUPRC)、36.3% (AP@50)”。

在當(dāng)前版本,該系統(tǒng)只能預(yù)測與藥物對相關(guān)的副作用,但研究團隊希望能夠提高軟件性能,對更復(fù)雜的藥物組合進行預(yù)測。為推動其在臨床環(huán)境中的應(yīng)用,他們還希望為醫(yī)生和醫(yī)學(xué)研究人員構(gòu)建更具用戶友好性的工具。

聲明:本文內(nèi)容及配圖由入駐作者撰寫或者入駐合作網(wǎng)站授權(quán)轉(zhuǎn)載。文章觀點僅代表作者本人,不代表電子發(fā)燒友網(wǎng)立場。文章及其配圖僅供工程師學(xué)習(xí)之用,如有內(nèi)容侵權(quán)或者其他違規(guī)問題,請聯(lián)系本站處理。 舉報投訴

原文標(biāo)題:人工智能幫助預(yù)測混合用藥的副作用

文章出處:【微信號:AI_News,微信公眾號:人工智能快報】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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